FKIP UPY menyelenggarakan pendidikan tinggi berbasis nilai-nilai ke-PGRI-an, kebangsaan, dan keilmuan yang berorientasi pada mutu, inovasi, serta integritas akademik. Fakultas ini memiliki berbagai program studi unggulan di bidang pendidikan yaitu:
Nama Program Studi Akreditasi
Pendidikan Profesi Guru (Baik Sekali)
S-2 Magister Pendidikan Dasar (Baik)
S-2 Pendidikan Ilmu Pendidikan Sosial (Unggul)
S-1 Pendidikan Guru Sekolah Dasar (PGSD) (Unggul)
S-1 Bimbingan dan Konseling (BK) (Unggul)
S-1 Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (PPKn) (Unggul)
S-1 Pendidikan Sejarah (Unggul)
S-1 Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (PBSI) (Baik Sekali)
S-1 Pendidikan Bahasa Inggris (PBI) (Baik Sekali)
S-1 Pendidikan Matematika (Baik Sekali)
S-1 Pendidikan Luar Biasa (PLB) (Baik)
S-1 Pendidikan Guru Pendidikan Anak Usia Dini (PG-PAUD) (Baik)
S-1 Pendidikan Vokasional Teknologi Otomotif (PVTO) (Baik)
Setiap program studi dirancang sesuai dengan kebutuhan dunia pendidikan abad ke-21 dan mengacu pada standar Outcome-Based Education (OBE). FKIP UPY dalam proses akademik didukung oleh tenaga pengajar yang kompeten, fasilitas pembelajaran yang representatif, serta sistem pembelajaran digital yang dinamis. Selain itu, FKIP UPY aktif menjalin kemitraan dengan berbagai sekolah, lembaga pemerintah, organisasi profesi, serta institusi luar negeri dalam rangka memperluas jejaring, memperkuat praktik lapangan, dan meningkatkan daya saing lulusan di tingkat nasional maupun global.
Sebagai bagian dari institusi yang berkomitmen pada tridharma perguruan tinggi, FKIP UPY juga aktif dalam kegiatan penelitian, pengabdian kepada masyarakat, serta pengembangan inovasi pendidikan yang relevan dengan tantangan lokal maupun global. Salah satu kekuatan unik fakultas ini adalah integrasi nilai-nilai budaya lokal dan kearifan lokal dalam pengembangan pendidikan karakter dan mitigasi bencana berbasis budaya.